Expression du génome bactérien

LOGICIEL « FORTS PROMOTEURS BACTÉRIENS »

L’algorithme (triad pattern) détecte les promoteurs forts dans les génomes bactériens et fournit des informations sur les gènes surexprimés. En particulier, il a été utilisé pour identifier les promoteurs à fort potentiel chez les bactéries coryneformes d’importance industrielle.

Consensus de promoteurs forts chez la bactérie hyperthermophile Thermotoga maritima.

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Références:

1. Dekthyar M., Morin A., Sakanyan V. Triad pattern algorithm for predicting strong promoter candidates in bacterial genomes. BMC Bioinformatics 2008, 9, 233, doi; 10.1186/1471-2105-9-233. PDF

2. Koloyan A. O., Hambardzumyan A. A., Hovsepyan A. S., Dekhtyar M. I., Saghiyan A. S., Sakanyan V. A. Virtual screening of coryneform bacteria genome for the presence of strong promoters. Biotechnologiya 2010, 1, 41-50.